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它们相互缠绕形成一个在中心分子轴周围的右手螺旋（三级结构）；完整的胶原蛋白分子的长度约280 nm，直径约1.5nm；在Ⅰ型胶原原纤维的二维结构（小角线衍射图谱和透射电子显微照片）中，胶原分子通过一个或多个4 D距离与另一个胶原分子交错。

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经 SDS 聚酰胺凝胶电泳分析其胶原蛋白是由三个独特α 链组成，按照它们的移动位置分别分别确定为α1、α3、α2链。氨基酸分析表明，燕窝代加工，S.meleagri水母外伞胶原质中甘氨酸含量，每1000个氨基酸残基含有309个甘氨酸。

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像来自日本海鲈、鲐鱼、大头鲨和眼斑鲀的皮胶原蛋白的变性温度为25.0~26.5℃，而骨胶原蛋白的变性温度则为29.5~30.0℃。附带是骨胶原蛋白的变性温度范围整体上比皮胶原蛋白的变性温度范围要高。

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